Sehenswürdig bei der aus dem 13. Jahrhundert stammenden St.Johannis Kirche ist die Ausstattung aus gotischer Zeit, so der Bentheimer Taufstein und die Strahlenmadonna aus dem Jahr 1517. Um die Kirche herum ist die Kirchhöfnerei entstanden, eine kleine idyllisch gelegene eng aneinander gebaute Häuserzeile, die eine Kirchburg entstehen ließ. Heute ist die Kirchhöfnerei weit über die Grenzen Alfhausen als besonderes Schmuckstück bekannt und ein besonderer Anziehungspunkt für Ausflügler und Besucher.
Weitere Sehenswürdigkeiten sind die Heeker Klause (erbaut 1818). Sie ist der Mittelpunkt des Ortsteiles Heeke, der im Jahr 2000 sein 800-jähriges Bestehen feiern konnte. Im Jahre 1912 grub man unter dem Boden der Klause nach einem Schatz, von dem der Volksmund berichtet. Man fand eine Reihe von Statuen die zum Teil im Heimatmuseum Bersenbrück aufbewahrt werden. Im Jahre 1970 wurde die Klause renoviert und eingeweiht. Das Madonnenbild, das heute in der Klause steht, hatte bei der Ausgrabung keine Farbe mehr und wurde bei der Renovierung neu gefaßt. Noch heute wird die Klause für Maiandachten und das jährliche Bittamt genutzt.
Seit der Zeit der Sachsen erzählt man sich die Sagen um die Alkenkuhlen. In diesen Erdfällen, Einbrüche durch Kalkauswaschungen entstanden, sollen Haus und Hof mit Mann und Maus verschwunden sein.
Von der Ortsmitte aus führen zahlreiche Wander- und Radwege in die abwechslungsreiche Landschaft. Der Alfsee (dessen „Taufpate“ die Gemeinde ist), die Wege entlang der Hase, vorbei an den alten Rittergütern der Meppenburg, Gut Twiestel und der Horst sind geprägt von Wasser, Wind und Weite. Das Naturschutzgebiet „Reservebecken“ und die biologische Station Haseniederung im „alten Backhaus“ am Alfsee bringen Sie der Natur ein Stück näher. Der Heiligenberg mit seinen sanften Hügeln und dichten Wäldern lädt Sie zum Wandern und entspannen ein. Nicht verpassen sollten Sie einen Blick vom Hexenboll. Von hier aus können Sie das Panorama weit in die Landschaft genießen.